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テイラー 幸恵（特任講師）
YUKIE AKUNE-TAYLOR
| 専門分野 | 糖鎖インフォマティクス、ライフサイエンス、生物分子化学 |
|---|---|
| 研究テーマ | 糖鎖インフォマティクスを用いた糖鎖-タンパク質相互作用の解析 |
| 研究内容 | 糖鎖は単糖が鎖状に連なった分子であり、炎症、シグナル伝達、免疫調節など、健康な状態なだけでなく、感染性および非感染性の疾患時における多様な認識システムに関与しています。そのため、糖鎖認識機構の解明は極めて重要な課題です。 現在では、糖鎖マイクロアレイやレクチンアレイなどの糖鎖-タンパク質相互作用を調べるための実験手法が多数発表されています。様々なアレイプラットフォームで解析されたデータは論文等で発表され、さらにリポジトリなどで公開されています。 本研究では、糖鎖のどの部位がタンパク質などの糖鎖結合サンプルと結合するためのモチーフとなるのかをアレイデータ、並びにメタデータを使用して解析しています。さらに、テキストマイニングやデータキュレーションを行うことで、より広い生物学的背景における糖鎖および糖鎖を介した分子間相互作用に関する知見を得ることを目的としています。 |
糖鎖生命システム融合研究所
略歴 2016年 8月 創価大学大学院 工学研究科 生命情報工学専攻 博士後期課程 修了
2016年 10月 Imperial College London (UK) ポストドクトラルフェロー
2017年 11月 Macquarie University (Australia) PhD. Programme
in Chemistry and Biomolecular Sciences 修了
2023年 9月 創価大学糖鎖生命システム融合研究所 特任講師主な著書論文 （原著論文）
Akune, Y., Arpinar, S., Silva, L. M., Palma, A. S., Tajadura-Ortega, V., Aoki-Kinoshita, K. F., ... & Feizi, T. (2022). CarbArrayART: a new software tool for carbohydrate microarray data storage, processing, presentation, and reporting. Glycobiology, 32(7), 552-555.
Bonnardel, F., Haslam, S. M., Dell, A., Feizi, T., Liu, Y., Tajadura-Ortega, V., ... & Imberty, A. (2021). Proteome-wide prediction of bacterial carbohydrate-binding proteins as a tool for understanding commensal and pathogen colonisation of the vaginal microbiome. npj Biofilms and Microbiomes, 7(1), 49.
Hosoda, M., Akune, Y., & Aoki-Kinoshita, K. F. (2017). Development and application of an algorithm to compute weighted multiple glycan alignments. Bioinformatics, 33(9), 1317-1323.
Akune, Y., Lin, C. H., Abrahams, J. L., Zhang, J., Packer, N. H., Aoki-Kinoshita, K. F., & Campbell, M. P. (2016). Comprehensive analysis of the N-glycan biosynthetic pathway using bioinformatics to generate UniCorn: A theoretical N-glycan structure database. Carbohydrate Research, 431, 56-63.
Campbell, M. P., Ranzinger, R., Lütteke, T., Mariethoz, J., Hayes, C. A., Zhang, J., ... & Lisacek, F. (2014). Toolboxes for a standardised and systematic study of glycans. BMC bioinformatics, 15, 1-11.
Campbell, M. P., Peterson, R., Mariethoz, J., Gasteiger, E., Akune, Y., Aoki-Kinoshita, K. F., ... & Packer, N. H. (2014). UniCarbKB: building a knowledge platform for glycoproteomics. Nucleic acids research, 42(D1), D215-D221.
Akune, Y., Hosoda, M., Kaiya, S., Shinmachi, D., & Aoki-Kinoshita, K. F. (2010). The RINGS resource for glycome informatics analysis and data mining on the Web. Omics: a journal of integrative biology, 14(4), 475-486.所属学会 日本バイオインフォマティクス学会、日本生化学学会、Society For Glycobiology、 International Society for Bioturbation