池口 雅道(教授)

イケグチ マサミチ

専門分野 生物分子科学、構造生物化学、生物物理学
担当科目 物理学序論、酵素化学、量子化学、構造生物学、構造情報生物学、タンパク質工学、バイオテクノロジー、理工学総論、先端理工学トピックス、ケーススタディⅠ・Ⅱ、演習Ⅰ・Ⅱ
研究テーマ 蛋白質の折れたたみ機構の解明

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工学研究科 生命情報工学専攻

  • 専門分野 蛋白質設計、構造情報生物学
    担当科目 物理学序論、量子化学、構造生物学、タンパク質工学
    研究テーマ タンパク質の立体構造はそのアミノ酸配列によって決められていることが知られています。したがって、アミノ酸配列から立体構造を予測したり、人工タンパク質を設計したりすることは可能なはずですが、現在ところその技術は確立されていません。私達はタンパク質の立体構造が形成される(フォールディング)反応をストップト・フロー法やNMRなどの物理化学的方法で調べ、遺伝子組換え技術によってタンパク質のアミノ酸配列を変えた時に、フォールディング反応がどのように変化するのかを探ることで、タンパク質の立体構造構築の原理を学び、アミノ酸配列から立体構造を予測したり、人工タンパク質を設計したりする技術を開発することを目指しています。
    略歴 1988年 北海道大学大学院博士課程修了
          理学博士
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    1987年 日本学術振興会特別研究員
    1989年 創価大学講師
    1995年 創価大学助教授
    2000年 Universitaet Bayreuth (Germany) 客員教授
    2002年 創価大学教授
    最近の主な論文 "A physicochemical and mutational analysis of intersubunit interactions of Escherichia coli ferritin A"
    Ohtomo, H., Ohtomo, M., Daisuke, S., Kurobe, A., Sunato, A., Matsumura, Y., Kihara, H., Fujiwara, K. & Ikeguchi, M.
    Biochemistry (2015) 54, 6243-6251
    "The origin of β-strand bending in globular proteins"
    Fujiwara, K., Ebisawa, S., Watanabe, Y., Fujiwara, H. & Ikeguchi, M.
    BMC Struct Biol. (2015) 15, 21
    "Effect of non-native helix destabilization on the folding of equine β-lactoglobulin"
    Okabe, T., Miyajima, T., Nakagawa, K., Tsukamoto, S., Fujiwara, K. & Ikeguchi, M.
    J. Biochem. (2014) 156, 291-297
    "Local sequence of protein β-strands influences twist and bend angles"
    Fujiwara, K., Ebisawa, S., Watanabe, Y., Toda, H. & Ikeguchi, M.
    Proteins: Struct. Funct. Bioinfo. (2014) 82, 1484-1493
    "α-Helix formation rate of oligopeptides at subzero temperatures"
    Qin, Z. J., Shimizu, A., Li, J., Ikeguchi, M., Shinjo, M. & Kihara, H.
    Biophysics (2014) 10, 9-13
    "Relationship between chain collapse and secondary structure formation in a partially folded protein"
    Nakagawa, K., Yamada, Y., Matsumura, Y., Tsukamoto, S., Yamamoto-Ohtomo, M., Ohtomo, H., Okabe, T., Fujiwara, K. & Ikeguchi, M.
    Biopolymers (2014) 101, 651-658
    "Delineation of solution burst-phase protein folding events by encapsulating the proteins in silica gels"
    Okabe, T., Tsukamoto, S., Fujiwara, K., Shibayama N. & Ikeguchi, M.
    Biochemistry (2014) 53, 3858-3866
    "Transient Non-Native Helix Formation during the Folding of β-Lactoglobulin"
    Ikeguchi, M.
    Biomolecules (2014) 4, 202-216
    "Dependence of alpha-helical and beta-sheet amino acid propensities on the overall protein fold type"
    Fujiwara, K., Toda, H. & Ikeguchi, M.
    BMC Struct. Biol. (2012) 12, 18
    "Importance of polypeptide chain length for the correct local folding of a β-sheet protein"
    Yamamoto, M., Nakagawa, K. & Ikeguchi, M.
    Biophys. Chem. (2012) 168-169, 40-47
    "Important role of methionine 145 in dimerization of bovine β-lactoglobulin"
    Ohtomo, H., Fujiwara, K. & Ikeguchi, M.
    J. Biochem. (2012) 151, 329-334
    "A Native Disulfide Stabilizes Non-Native Helical Structures in Partially Folded States of Equine β-Lactoglobulin"
    Yamamoto, M., Nakagawa, K., Fujiwara, K., Shimizu, A., Ikeguchi, M. & Ikeguchi, M.
    Biochemistry (2011) 50, 10590-10597
    "Structure and stability of Gyuba, a β-lactoglobulin chimera"
    Ohtomo, H., Konuma, T., Utsunomiya, H., Tsuge, H. & Ikeguchi, M.
    Protein Sci. (2011) 20, 1867-1875
    "Fatty acids bound to recombinant tear lipocalin and their role in structural stabilization"
    Tsukamoto, S., Fujiwara, K. & Ikeguchi, M
    J. Biochem. (2009) 146, 343-350
    "Non-native alpha-helix formation is not necessary for folding of lipocalin: comparison of burst-phase folding between tear lipocalin and beta-lactoglobulin"
    Tsukamoto S, Yamashita T, Yamada Y, Fujiwara K, Maki K, Kuwajima K, Matsumura Y, Kihara H, Tsuge H, Ikeguchi M.
    Proteins. (2009) 76, 226-236
    "OLIGAMI: OLIGomer Architecture and Molecular Interface"
    Fujiwara K & Ikeguchi M.
    Open Bioinfo. J. (2008) 2, 50-53
    "Helix-Rich Transient and Equilibrium Intermediates of Equine β−Lactoglobulin in Alkaline Buffer"
    Matsumura Y, Li J, Ikeguchi M & Kihara H
    Biophys. Chem. (2008) 134, 84-92
    "Chloride-ion Concentration Dependence of Molecular Dimension in the Acid-Denatured State of Equine β−Lactoglobulin"
    Yamada Y, Yajima T, Tsukamoto S, Nakagawa K, Fujiwara K, Kihara H & Ikeguchi M
    J. Appl. Crystallogr. (2007) 40, s213-s216
    "An Alpha-Helical Burst in the src SH3 Folding Pathway"
    Li J, Shinjo M, Matsumura Y, Morita M, Baker D, Ikeguchi M & Kihara H
    Biochemistry (2007) 46, 5072-5082
    "Interactions responsible for secondary structure formation during folding of equine β-lactoglobulin"
    Nakagawa K, Yamada Y, Fujiwara K & Ikeguchi M
    J. Mol. Biol. (2007) 367, 1205-1214
    "Proline Scanning Mutagenesis Reveals Non-Native Fold in the Molten Globule State of Equine β-Lactoglobulin"
    Nakagawa, K., Tokushima, A., Fujiwara, K. & Ikeguchi, M.
    Biochemistry (2006) 45, 15468 - 15473
    "Structural and Thermodynamic Consequences of Removal of a Conserved Disulfide Bond from Equine beta-Lactoglobulin"
    Yamada, Y., Nakagawa, K., Yajima, T., Saito, K., Tokushima, A., Fujiwara, K. & Ikeguchi, M.
    Proteins: Struct Funct Bioinfo (2006) 63, 595-602
    "Helical and Expanded Conformation of Equine beta-Lactoglobulin in the Cold-denatured State"
    Yamada Y., Yajima T., Fujiwara K., Arai M., Ito K., Shimizu A., Kihara H., Kuwajima K., Amemiya Y. & Ikeguchi M.
    J Mol Biol (2005) 350, 338-348
    所属学会 日本生化学会
    日本生物物理学会
    日本分子生物学会
    日本蛋白質科学会
    日本核磁気共鳴学会
    高分子学会
    The Protein Society (USA)

ページ公開日:2017年08月07日
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